El ente encargado de ejecutar las líneas estratégicas establecidas por la Asamblea General es el Consejo de Directores, que cuenta con una representación equilibrada de las diferentes subregiones y principales productos del continente.

El Consejo de Directores elegido en la Asamblea General de El Salvador (2015) para el período 2016-2018 está compuesto por los siguientes representantes:

Marike de Peña Presidenta, Representante del Caribe Rep. Dominicana
Merling Preza Vicepresidenta, Representante de Centroamérica Nicaragua
Bernal Valverde Secretario, Representante de la Red de Azúcar Costa Rica
Luis Martínez Director, Representante de México México
Luis Fernando Peña Director, Representante Sudamérica Perú
André Reis Director, Representante Sudamérica Brasil
Harold Suárez Director, Representante de la Red de Trabajadores Colombia
Miguel Munguía Director, Representante de la Red de Miel México
Carlos Reynoso Director, Representante de la Red de Café Guatemala
Lina Trujillo Directora, Representante de la Red de Café Colombia
Aimeth Fernández Directora, Representante de la Red de Banano Colombia
Hidelbrando Cárdenas Director, Representante de la Red de Cacao Perú
Joao Roberto Gasperini Director, Representante de la Red de Jugos y Frutas Brasil
Zenón Panamá Tito Director, Representante de la Red de Quinoa Bolivia
Zulma Avilés Ramírez Directora, Representante de Otros Productos. Bolivia