A CLAC tem suas raízes na criação dos primeiros selos de comércio justo, no final dos anos 80. Os antecedentes  formais da CLAC começam com  a Coordenadora Latino-americana de Pequenos Produtores de Café (CLA o “Coordenadora”) e com a Rede Latino-americana de Pequenos Apicultores, PAUAL (Pequenos Apicultores Unidos da América Latina), ambos fundados em 1996.

Durante a Quinta Assembléia Regional da CLA, celebrada em Agosto de 2004 em Oaxaca, México, se constituiu a CLAC como uma entidade legal, incorporando as representações dos pequenos produtores do Comércio Justo da América Latina e do Caribe – já com uma ampla variedade de produtos.